Para a determinação da origem da doença de causa conhecida, faz-se necessário, previamente, o diagnóstico conclusivo pelo isolamento do agente causal. Após a determinação, o pesquisador deve fazer as seguintes perguntas para seu grupo e para si: por que ocorreu o surto? Por que o número de casos aumentou? Em seguida, investigações epidemiológicas serão postas em prática para que haja a determinação dos fatores associados à ocorrência de casos e, assim, a elaboração de medidas de prevenção e controle específicas para o evento em questão. No caso da investigação e controle de doença de causa desconhecida ou pouco compreendida, é necessário fazer observações epidemiológicas minuciosas, visto que, em muitos casos de investigação durante o evento, o descobrimento do agente etiológico pode demorar semanas. Por isso, pesquisadores da área devem se esforçar ao máximo para responder às perguntas: quais são as espécies, os gêneros e as categorias acometidas? Qual o tamanho da extensão do evento? Há presença de vetor? Há relação ambiental? Socioeconômica? Cultural? Política?
